More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2561 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2561  porin  100 
 
 		 427 aa  861    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000690644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  27.25 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  32.46 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.87 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.52 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  24.78 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  27.68 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  43.07 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.33 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.08 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  35.33 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  27.17 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.89 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  25.61 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  26.06 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  26.06 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  28.08 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.89 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  25.61 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  28.7 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  27.64 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.89 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  34.3 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  33.7 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.37 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.37 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  27.78 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  27.78 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  27.78 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  27.78 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  33.33 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  27.78 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  27.78 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  33.33 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  37.36 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34.95 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4872  porin  32.62 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0644122  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  27.11 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  40.17 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  32.97 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  26.56 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  25.17 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  39.53 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  39.53 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  39.53 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  39.53 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  28.6 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  31.63 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  27.11 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  33.33 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  28.38 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  27.56 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  25.39 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  32.35 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  26 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  27.29 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  32.8 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  26.82 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  26.82 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0328  OmpC family outer membrane porin  31.44 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000489556  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  32.8 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.59 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  25.67 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  37.01 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.59 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  38.73 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  26.08 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  30.43 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  32.28 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  29.83 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  32.28 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.33 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.7 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  32.28 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  34.97 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  32.28 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  26.41 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  26.41 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  34.38 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.98 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  35.03 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  34.39 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  34.43 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  34.43 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1814  Outer membrane protein (porin)-like protein  25.66 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000274803  hitchhiker  0.000000000255936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  34.39 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>