More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3886 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3886  porin  100 
 
 		 351 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426254  normal  0.191492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2481  outer membrane protein (porin)  95.17 
 
 		 352 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.587098  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3027  outer membrane protein (porin)  65.34 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0984203  normal  0.75673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5937  porin  57.91 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3269  porin  56.76 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00595502  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  53.43 
 
 		 352 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5649  outer membrane protein (porin)  57.56 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5210  outer membrane protein (porin)  57.56 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00719172  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  33.05 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0350  OmpC family outer membrane porin  32.8 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000145681  hitchhiker  0.00000929748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  35.59 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  33.76 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  30.38 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.51 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.81 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.55 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.55 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.3 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.54 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.54 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.25 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  34.11 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  34.11 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  34.11 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  34.11 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  31.94 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.75 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  38.36 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  31.3 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.59 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.49 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  33.5 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.66 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  39.3 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  39.3 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  30.83 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  34.53 
 
 		 378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.24 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  34.11 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.02 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.13 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  31.36 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  31.36 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.85 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  34.11 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  34.11 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.85 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.03 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.85 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.83 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.85 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.85 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.85 
 
 		 436 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.53 
 
 		 389 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.03 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  31.39 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  31.39 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  31.39 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.03 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  39.29 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  34.05 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  31.02 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  32.56 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  31.02 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  31.02 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  33.96 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  30.03 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  33.93 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.77 
 
 		 380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  39.2 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.88 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  36.34 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.56 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  31.4 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  31.3 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.14 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.29 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.4 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  31.4 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.4 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  30.05 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.68 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  32.06 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  32.61 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  35.25 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  35.25 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  35.25 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  35.25 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  31.78 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  32.99 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  35.59 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  31.67 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.23 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  31.67 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>