More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2430 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  100 
 
 		 379 aa  765    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  36.44 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  26.99 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  25.53 
 
 		 567 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  24.17 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  24.67 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.13 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  24.23 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.01 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.34 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  25.81 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  24.1 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.35 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.74 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.29 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.07 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  24.35 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.87 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.57 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  22.4 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.75 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  23.27 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.88 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.47 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.68 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.32 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.28 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.28 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.45 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.61 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.63 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.14 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.29 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.47 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  24.14 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  24.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.47 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  24.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  24.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  24.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  24.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  23.47 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  21.49 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.2 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  20.7 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  22.44 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.03 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.83 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  22.25 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  20.45 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  24.06 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  18.97 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  20.17 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.39 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  21.88 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.37 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.81 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.66 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  22.75 
 
 		 463 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 710 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  23.67 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.82 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.84 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  22.84 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.84 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  22.51 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  21.01 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  22.72 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  30.72 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  20.6 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.04 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.72 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  33.64 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0252  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  23.33 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.77 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  21.86 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.92 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.87 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.74 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  26.1 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  22.25 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  27.1 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  20 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.94 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  29.22 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.69 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  21.85 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  20.78 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  23.28 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.23 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.62 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.53 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.3 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.56 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  23.1 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.69 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.51 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>