More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12190 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  54.44 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 342 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  48.86 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  48.86 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  47.73 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  49.45 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  41.24 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 343 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>