198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2563 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1000 aa  1898    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  31.05 
 
 		 1008 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.06 
 
 		 1007 aa  285  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.31 
 
 		 1003 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.58 
 
 		 1016 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.91 
 
 		 1007 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  25.37 
 
 		 1008 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  25.92 
 
 		 1008 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.33 
 
 		 1019 aa  164  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  26.7 
 
 		 1031 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.3 
 
 		 857 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1022 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  26.72 
 
 		 1023 aa  94.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  27.87 
 
 		 895 aa  92.8  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.62 
 
 		 924 aa  92.8  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.95 
 
 		 961 aa  91.7  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.3 
 
 		 859 aa  91.7  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  17.55 
 
 		 864 aa  90.1  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 		 1022 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  16.67 
 
 		 994 aa  84.7  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.24 
 
 		 902 aa  84  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  28.73 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  28.18 
 
 		 859 aa  81.3  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  17.26 
 
 		 993 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  16.11 
 
 		 993 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  20.66 
 
 		 1019 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  16.43 
 
 		 993 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  30.17 
 
 		 904 aa  79  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.98 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  19.83 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  27.18 
 
 		 1029 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  31.25 
 
 		 1025 aa  75.1  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.35 
 
 		 906 aa  75.1  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.63 
 
 		 1018 aa  75.1  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 852 aa  74.7  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 1057 aa  73.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  22.86 
 
 		 1032 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  24.08 
 
 		 890 aa  72.8  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  21.14 
 
 		 1011 aa  72.4  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.41 
 
 		 851 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.19 
 
 		 1021 aa  70.1  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  22.81 
 
 		 1029 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  24.15 
 
 		 1018 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  23.52 
 
 		 1020 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  20.48 
 
 		 1029 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.92 
 
 		 1009 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  20.97 
 
 		 888 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  26.38 
 
 		 1099 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26.67 
 
 		 1165 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  20.08 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  26.03 
 
 		 1172 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  26.03 
 
 		 1172 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  29.75 
 
 		 1023 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  24.86 
 
 		 1009 aa  67  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  24.86 
 
 		 1009 aa  67  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  24.35 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  19.86 
 
 		 1029 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  21.06 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.31 
 
 		 1114 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.46 
 
 		 926 aa  65.1  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  23.86 
 
 		 1074 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  20.05 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  20.49 
 
 		 1061 aa  64.7  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  20.31 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  21.05 
 
 		 1180 aa  63.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  17.24 
 
 		 802 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  21.52 
 
 		 1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  19.92 
 
 		 1029 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  19.92 
 
 		 1029 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  27.8 
 
 		 1020 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  20.25 
 
 		 1039 aa  62.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  19.92 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  18.84 
 
 		 1108 aa  62.4  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 1230 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  24.14 
 
 		 1020 aa  62  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.27 
 
 		 702 aa  62  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  19.83 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.3 
 
 		 1033 aa  59.7  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 1018 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.94 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  27.76 
 
 		 1227 aa  58.9  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  23.32 
 
 		 1013 aa  58.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  25.06 
 
 		 1018 aa  58.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  24.91 
 
 		 1018 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  20.41 
 
 		 1030 aa  57  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 1018 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  28.18 
 
 		 881 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  20.55 
 
 		 978 aa  57  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  26.51 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  26.74 
 
 		 1018 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  23.39 
 
 		 1227 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  26.14 
 
 		 995 aa  55.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  20.38 
 
 		 702 aa  55.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 		 824 aa  55.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.52 
 
 		 812 aa  55.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  32.14 
 
 		 514 aa  55.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  27.12 
 
 		 1103 aa  55.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  25.58 
 
 		 1018 aa  54.3  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  27.32 
 
 		 815 aa  54.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>