119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2152 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  832    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  26.92 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  26.2 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  24.28 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  25.51 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  26.2 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  26.23 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  25.67 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  23.71 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  28.05 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  28.05 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  25.47 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  27.98 
 
 		 582 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  24.75 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  23.18 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  24.52 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.34 
 
 		 607 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  23.51 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  22.54 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  23.38 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  23.86 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  24.16 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  23.51 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  26.03 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  23.22 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  22.11 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  22.11 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  21.6 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  23.06 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  21.3 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  21.6 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  21.6 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  22.86 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  21.6 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  21.6 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  21.3 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  21.3 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  24.3 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  22.65 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  23.91 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  23.22 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  24.28 
 
 		 394 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  24.33 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  23.27 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.9 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  27.69 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  30.11 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  24.33 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  25.43 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  28.27 
 
 		 334 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  24.07 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  22.77 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  23.7 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  28.12 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  28.12 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  23.85 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  20.86 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  24.57 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  30.56 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  24 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  30.83 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  24.5 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  28.73 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.98 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  22.52 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.04 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  28.11 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  24.22 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  28.3 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  23.92 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  28.3 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>