More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2423 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  82.79 
 
 
215 aa  339  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  47.2 
 
 
214 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  42.06 
 
 
228 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 
212 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 
217 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  42.33 
 
 
212 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  43.72 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  44.65 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  44.65 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  44.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  43.26 
 
 
217 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  40 
 
 
217 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  36.49 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 
517 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.97 
 
 
220 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  34.78 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  33.52 
 
 
394 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 
363 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
363 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 
351 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 
371 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
363 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  33.07 
 
 
364 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  38.21 
 
 
325 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  32.28 
 
 
364 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
364 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  33.07 
 
 
364 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  36.36 
 
 
410 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 
400 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 
351 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  33.59 
 
 
347 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 
351 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
352 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 
373 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  42.02 
 
 
422 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 
358 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.61 
 
 
348 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.46 
 
 
374 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  35.82 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  30.56 
 
 
355 aa  85.1  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 
375 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  33.33 
 
 
372 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  30.95 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.61 
 
 
344 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.33 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 
366 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
352 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 
359 aa  81.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.09 
 
 
364 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  36.19 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  29.83 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  33.07 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.86 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  35.34 
 
 
444 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.6 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
387 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 
375 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 
453 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  31.75 
 
 
332 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
328 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
387 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  34.55 
 
 
405 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.06 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  32.19 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  32.82 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  34.53 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  32.56 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  34.85 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  36.72 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.92 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  29.84 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  32.67 
 
 
354 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.4 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 
366 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  32.85 
 
 
448 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  31.34 
 
 
419 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 
423 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>