125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0479 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0479  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.76967  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  45.45 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  51.11 
 
 		 868 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 936 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 929 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  52.5 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  43.18 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  40.91 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  45.45 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  54.05 
 
 		 903 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.83 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 998 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  40.91 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  56.41 
 
 		 963 aa  43.5  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  50 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  46 
 
 		 963 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  50 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  50 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45 
 
 		 222 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 956 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  47.5 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  40.91 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  40.91 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  40.91 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  51.22 
 
 		 865 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  45.61 
 
 		 955 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 201 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 201 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 212 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  43.9 
 
 		 207 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 224 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 952 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 952 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 845 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 238 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 215 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.51 
 
 		 258 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 755 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  40.91 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 1104 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 765 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  43.18 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.81 
 
 		 862 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.91 
 
 		 222 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  30.61 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  48.84 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  36.17 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  48.98 
 
 		 917 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  47.62 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 927 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  42.22 
 
 		 252 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 191 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 947 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>