275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 702 aa  1401    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  99.31 
 
 		 298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0395  hypothetical protein  38.34 
 
 		 488 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  39.23 
 
 		 828 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  42.33 
 
 		 924 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1068 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  36.02 
 
 		 1050 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1105 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.07 
 
 		 1424 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 		 1262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1088 aa  130  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 		 1185 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 		 991 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 857 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 		 1288 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 949 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.41 
 
 		 1488 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.24 
 
 		 1131 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  40.34 
 
 		 1056 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 751 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 568 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 568 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1039 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.46 
 
 		 1328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 		 1128 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  36.4 
 
 		 801 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 911 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 1040 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1215 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  35.02 
 
 		 713 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 		 953 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 		 1186 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  35.24 
 
 		 963 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.55 
 
 		 675 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 776 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 577 aa  99  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2793  tetratricopeptide TPR_4  34.86 
 
 		 1024 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.51 
 
 		 829 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2145 aa  97.8  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1550 aa  97.4  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 814 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.65 
 
 		 825 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 767 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 843 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  33.18 
 
 		 1125 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.8 
 
 		 1324 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1212 aa  94.4  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.81 
 
 		 362 aa  94  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 		 1290 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 787 aa  92  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 		 885 aa  91.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 444 aa  90.5  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  33.9 
 
 		 934 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 		 304 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 		 1475 aa  88.2  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  33.47 
 
 		 899 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  30.92 
 
 		 1314 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1383 aa  87  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  28.42 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.55 
 
 		 1311 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  32.2 
 
 		 1106 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  33.69 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 725 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  29.79 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 		 1507 aa  84.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.05 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.19 
 
 		 672 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 966 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  27.72 
 
 		 680 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  35.68 
 
 		 847 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 1146 aa  81.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.35 
 
 		 841 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1283 aa  80.9  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  36.91 
 
 		 1676 aa  80.9  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  35.8 
 
 		 838 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.11 
 
 		 771 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  32.11 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  34.12 
 
 		 849 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1028 aa  78.2  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  30.98 
 
 		 1429 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1123 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.94 
 
 		 843 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.81 
 
 		 732 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  36.54 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 1468 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  34.05 
 
 		 936 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.29 
 
 		 822 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.4 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.73 
 
 		 1036 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 190 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.56 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>