96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1902 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  45.89 
 
 
344 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.2 
 
 
963 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  36.33 
 
 
1056 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.51 
 
 
1488 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 
702 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  38.06 
 
 
801 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
767 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 
1050 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
1128 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
837 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 
1185 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
1105 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.66 
 
 
1039 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
949 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
1262 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.08 
 
 
1186 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
1215 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 
1040 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
843 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
1288 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.23 
 
 
1131 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.87 
 
 
1328 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.19 
 
 
1475 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
924 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.38 
 
 
1068 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  29.39 
 
 
1468 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 
991 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 
919 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.03 
 
 
672 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  34.34 
 
 
457 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33193  predicted protein  33.33 
 
 
885 aa  58.9  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.627765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
814 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.35 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
857 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
469 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
751 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  29.63 
 
 
680 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
776 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.77 
 
 
828 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.11 
 
 
713 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.53 
 
 
825 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
1146 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
1125 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
444 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.2 
 
 
686 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.34 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
953 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
1290 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.32 
 
 
2145 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25.49 
 
 
1106 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.41 
 
 
1507 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
911 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
454 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
481 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6335  hypothetical protein  45.61 
 
 
144 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.04 
 
 
1324 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
771 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 
725 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.32 
 
 
1314 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
1435 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 
1136 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.36 
 
 
841 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1658  Tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856151  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
1028 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  33.93 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.05 
 
 
694 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 
787 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  32.58 
 
 
899 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  20.1 
 
 
740 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.33 
 
 
1228 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 
212 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.65 
 
 
1424 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.25 
 
 
919 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
669 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25 
 
 
732 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.09 
 
 
822 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  27.33 
 
 
849 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 
968 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.5 
 
 
847 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  32.31 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
715 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.27 
 
 
810 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
878 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  18.93 
 
 
1550 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
577 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1818  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
229 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
885 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
1088 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
966 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  24.62 
 
 
838 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>