More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1852 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1852  ATPase  100 
 
 		 745 aa  1526    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  34.62 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  27.67 
 
 		 762 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  27.28 
 
 		 747 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  27.58 
 
 		 749 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  27.94 
 
 		 742 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  29.67 
 
 		 738 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  29.57 
 
 		 749 aa  267  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  29.99 
 
 		 726 aa  267  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  28.15 
 
 		 711 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  28.87 
 
 		 731 aa  264  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  28.07 
 
 		 750 aa  264  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  27.96 
 
 		 746 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  27.68 
 
 		 738 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  28.1 
 
 		 733 aa  261  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  28.09 
 
 		 741 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.4 
 
 		 728 aa  260  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  30.24 
 
 		 739 aa  260  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  28.03 
 
 		 742 aa  260  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  27.93 
 
 		 744 aa  260  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  29.73 
 
 		 740 aa  260  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  27.91 
 
 		 736 aa  259  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.77 
 
 		 727 aa  256  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  28.1 
 
 		 733 aa  256  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.93 
 
 		 740 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  27.34 
 
 		 750 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  29.79 
 
 		 724 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  29.48 
 
 		 728 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  28.1 
 
 		 728 aa  252  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.07 
 
 		 737 aa  252  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  28.65 
 
 		 722 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  28.19 
 
 		 728 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  28.03 
 
 		 754 aa  249  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  28.02 
 
 		 727 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  29.17 
 
 		 735 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.88 
 
 		 744 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  28.87 
 
 		 742 aa  247  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.99 
 
 		 731 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  28.17 
 
 		 732 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  28.16 
 
 		 728 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  26.25 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.77 
 
 		 742 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  28.95 
 
 		 719 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  27.48 
 
 		 733 aa  244  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  27.86 
 
 		 688 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.61 
 
 		 731 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  27.19 
 
 		 739 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  28.07 
 
 		 725 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  29.47 
 
 		 744 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  27.87 
 
 		 768 aa  240  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  28.63 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.51 
 
 		 731 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  28.76 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  26.45 
 
 		 735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  29.07 
 
 		 744 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  28.4 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  28.14 
 
 		 731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.82 
 
 		 738 aa  234  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  28.19 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.32 
 
 		 746 aa  231  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  28.16 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.25 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.25 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  28.09 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  26.25 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  26.12 
 
 		 778 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  27.47 
 
 		 732 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  26.12 
 
 		 778 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  28.08 
 
 		 741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  26.25 
 
 		 778 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  26.49 
 
 		 778 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  26.25 
 
 		 770 aa  218  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  26.12 
 
 		 778 aa  217  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  26.12 
 
 		 778 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  26.8 
 
 		 784 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  26.78 
 
 		 772 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.81 
 
 		 813 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  28.02 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.65 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  26.9 
 
 		 786 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  26.58 
 
 		 740 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  26.61 
 
 		 825 aa  205  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  26.61 
 
 		 825 aa  205  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  27.59 
 
 		 806 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  26.01 
 
 		 719 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  27.46 
 
 		 834 aa  201  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  25.86 
 
 		 724 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.89 
 
 		 825 aa  196  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  25.66 
 
 		 720 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  26.18 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  26.47 
 
 		 810 aa  191  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  27.64 
 
 		 719 aa  191  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  26.63 
 
 		 715 aa  187  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.64 
 
 		 795 aa  187  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  25.71 
 
 		 772 aa  180  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.38 
 
 		 740 aa  180  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  25.92 
 
 		 698 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.51 
 
 		 698 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  27.87 
 
 		 761 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.91 
 
 		 833 aa  165  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>