More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1370 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  67.91 
 
 		 900 aa  849    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  66.15 
 
 		 954 aa  843    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  65.71 
 
 		 930 aa  808    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  66.25 
 
 		 1012 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  69.21 
 
 		 951 aa  868    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  68.57 
 
 		 612 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  67.76 
 
 		 920 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 		 957 aa  885    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  71.82 
 
 		 1046 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  67.5 
 
 		 969 aa  842    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  79.91 
 
 		 980 aa  1011    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  55.16 
 
 		 957 aa  920    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  68.08 
 
 		 998 aa  858    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  70.41 
 
 		 992 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.87 
 
 		 961 aa  863    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  69.31 
 
 		 930 aa  877    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  68.38 
 
 		 934 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 999 aa  1952    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  68.45 
 
 		 1034 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  67.76 
 
 		 920 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  70.14 
 
 		 939 aa  885    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.72 
 
 		 1004 aa  876    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.47 
 
 		 1029 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  66.77 
 
 		 968 aa  858    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  60.35 
 
 		 954 aa  767    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  64.65 
 
 		 879 aa  894    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  71.73 
 
 		 1051 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  69.22 
 
 		 938 aa  859    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  66.88 
 
 		 938 aa  843    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  67.76 
 
 		 920 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  67.86 
 
 		 930 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  60.35 
 
 		 975 aa  762    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.71 
 
 		 907 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.58 
 
 		 985 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.41 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 732 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 920 aa  603  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.54 
 
 		 903 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 979 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 964 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 860 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 739 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 922 aa  598  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 968 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 964 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50.98 
 
 		 904 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 971 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 		 986 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 971 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 971 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 		 972 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 		 924 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 876 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 976 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.59 
 
 		 971 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.74 
 
 		 921 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.92 
 
 		 1079 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 883 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 980 aa  589  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 972 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 947 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 		 896 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.66 
 
 		 949 aa  588  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 964 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 911 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 896 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 884 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 992 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 971 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 936 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  42.98 
 
 		 882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 986 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 969 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 884 aa  582  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 898 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 692 aa  582  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.96 
 
 		 888 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 896 aa  577  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 885 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.71 
 
 		 885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 894 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 1161 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 991 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 989 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 948 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 984 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.49 
 
 		 962 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>