More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0303 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 3273 aa  6641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2096 aa  299  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.48 
 
 		 3027 aa  275  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1959 aa  266  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.66 
 
 		 1271 aa  260  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1917 aa  249  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1840 aa  239  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.98 
 
 		 1669 aa  231  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1942 aa  229  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.33 
 
 		 2149 aa  225  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 3689 aa  222  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1352 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 2035 aa  201  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.01 
 
 		 1485 aa  193  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.34 
 
 		 1953 aa  189  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.64 
 
 		 2277 aa  182  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.65 
 
 		 1467 aa  178  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.79 
 
 		 2731 aa  177  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1600 aa  171  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 3073 aa  169  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 2942 aa  169  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  53.05 
 
 		 2615 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 2486 aa  160  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1390 aa  155  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.09 
 
 		 1485 aa  154  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1197 aa  152  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.48 
 
 		 1576 aa  151  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.26 
 
 		 2350 aa  145  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  50.31 
 
 		 1140 aa  144  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.26 
 
 		 1518 aa  141  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.21 
 
 		 1381 aa  139  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.18 
 
 		 1599 aa  138  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1492 aa  136  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1466 aa  135  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.86 
 
 		 1434 aa  134  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  24.26 
 
 		 6272 aa  132  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.81 
 
 		 1528 aa  130  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.16 
 
 		 1488 aa  128  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1611 aa  127  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.24 
 
 		 1464 aa  126  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.97 
 
 		 1626 aa  125  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.46 
 
 		 1008 aa  124  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.46 
 
 		 1008 aa  124  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.66 
 
 		 1595 aa  124  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 2294 aa  123  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.17 
 
 		 2246 aa  123  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  25.97 
 
 		 765 aa  122  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25 
 
 		 1543 aa  122  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 2003 aa  122  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.21 
 
 		 2225 aa  122  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  29.29 
 
 		 1160 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1177 aa  122  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25 
 
 		 1552 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1553 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1147 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.12 
 
 		 678 aa  121  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.05 
 
 		 2178 aa  121  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.06 
 
 		 1614 aa  120  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.98 
 
 		 1384 aa  120  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  27.1 
 
 		 2221 aa  120  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.45 
 
 		 1345 aa  120  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.7 
 
 		 765 aa  120  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.45 
 
 		 1345 aa  120  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  41.21 
 
 		 2290 aa  119  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.87 
 
 		 1539 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1834 aa  119  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.16 
 
 		 2224 aa  119  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.16 
 
 		 2224 aa  119  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.06 
 
 		 2144 aa  119  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  26.28 
 
 		 1046 aa  119  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1560 aa  118  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 3193 aa  118  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1623 aa  117  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.06 
 
 		 1586 aa  117  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1541 aa  117  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.1 
 
 		 1259 aa  117  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.28 
 
 		 1379 aa  117  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1198 aa  117  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1541 aa  116  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1541 aa  116  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1541 aa  116  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1541 aa  116  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.15 
 
 		 1572 aa  116  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1531 aa  116  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1551 aa  116  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  23.66 
 
 		 1539 aa  116  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1547 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.91 
 
 		 1577 aa  115  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1381 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1319 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.35 
 
 		 1732 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1541 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  24.41 
 
 		 1308 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  24.41 
 
 		 1388 aa  115  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27 
 
 		 2224 aa  115  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  24.55 
 
 		 1409 aa  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1763 aa  115  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  24.14 
 
 		 1397 aa  114  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  24.14 
 
 		 1411 aa  114  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  46.84 
 
 		 614 aa  114  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>