More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0796 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 722 aa  1450    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 565 aa  121  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.39 
 
 		 627 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 569 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 597 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 557 aa  99  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 557 aa  98.2  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 559 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 557 aa  97.4  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.18 
 
 		 545 aa  96.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 531 aa  92.4  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 636 aa  91.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 551 aa  91.3  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 553 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 810 aa  84.7  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.17 
 
 		 565 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 608 aa  73.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 579 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.09 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 821 aa  70.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.57 
 
 		 544 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.64 
 
 		 563 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.91 
 
 		 560 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  21.91 
 
 		 541 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  22.53 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.55 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 645 aa  67.4  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 794 aa  67.4  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 581 aa  67  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 576 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.3 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.3 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.79 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.3 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.3 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.3 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.3 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.3 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  25.3 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  25.3 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  23.33 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.01 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 515 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.03 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  22.73 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.27 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 557 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.58 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.36 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 774 aa  59.7  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.86 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>