285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1370 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  877    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  48.48 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  44.36 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.68 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.06 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.3 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  28.7 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.66 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.52 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.92 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.77 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.62 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.9 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  30.17 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.2 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.92 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.92 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.64 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.13 
 
 		 446 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.25 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.14 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.21 
 
 		 448 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  27.52 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.9 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.2 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.07 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  28.77 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.71 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.6 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.61 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.74 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.61 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.43 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.81 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.81 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.56 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.86 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.27 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.73 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.16 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.9 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.45 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30.59 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.13 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.7 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.19 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.92 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.07 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.62 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.24 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.46 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.67 
 
 		 505 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.5 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  24.63 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  24.92 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  29.86 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  24.63 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  24.63 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.87 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.52 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.83 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.92 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.51 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.17 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.77 
 
 		 462 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25.83 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.06 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  24.92 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  25.46 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.61 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.57 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.6 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  25.88 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.66 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.78 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.69 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  25.34 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  22.7 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.1 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.68 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  21.34 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.83 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.01 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.94 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  24 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.74 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.97 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  23.64 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  25 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  25.62 
 
 		 717 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  23.78 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  24.85 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.86 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>