More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  33.51 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  32.74 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  28.19 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  41.94 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  32.95 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  25.79 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28.03 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  41.38 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  25.95 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  31.96 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  25.58 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 677 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>