157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5019 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 455 aa  896    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 1119 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 578 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.12 
 
 		 732 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 702 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 1186 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1215 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1147 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1276 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.55 
 
 		 2145 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  36.63 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.89 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.75 
 
 		 1328 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  29.28 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  34.09 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.51 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.1 
 
 		 1507 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 1694 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1550 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 927 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1105 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 4489 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 4079 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.76 
 
 		 825 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 843 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.85 
 
 		 632 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1123 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 3560 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  21.58 
 
 		 1007 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1404 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  38.46 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1094 aa  57.4  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1437 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  18.08 
 
 		 602 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.5 
 
 		 887 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 3035 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1212 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 997 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 1737 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.36 
 
 		 672 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 955 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.74 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 568 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.94 
 
 		 955 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 568 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 162 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 924 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 907 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 681 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.32 
 
 		 560 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.02 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.33 
 
 		 623 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1212 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 991 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 685 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1039 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  20.31 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 363 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.68 
 
 		 573 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31.75 
 
 		 1228 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 		 665 aa  50.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 250 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  22.76 
 
 		 807 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  33.91 
 
 		 944 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  20.05 
 
 		 1266 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 162 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25 
 
 		 622 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 909 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.08 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.38 
 
 		 740 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 761 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.2 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 885 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 244 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.81 
 
 		 707 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 639 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 711 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.45 
 
 		 816 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 		 1363 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 684 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.11 
 
 		 865 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1069 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 362 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 202 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 360 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>