102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3922 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1261 aa  2614    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  28.65 
 
 		 1427 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  28.63 
 
 		 1403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  28.67 
 
 		 1457 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.37 
 
 		 1271 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1275 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1259 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  28.79 
 
 		 1255 aa  140  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.31 
 
 		 1408 aa  135  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.59 
 
 		 1428 aa  124  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.84 
 
 		 606 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.65 
 
 		 636 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.9 
 
 		 686 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.97 
 
 		 934 aa  88.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.73 
 
 		 1077 aa  87  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.52 
 
 		 797 aa  86.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.89 
 
 		 902 aa  85.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 1584 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.35 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.89 
 
 		 986 aa  82.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.36 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.69 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.08 
 
 		 650 aa  81.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.71 
 
 		 650 aa  81.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.78 
 
 		 1090 aa  78.2  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.3 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.6 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.2 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.47 
 
 		 1048 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.63 
 
 		 609 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.08 
 
 		 622 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.42 
 
 		 1250 aa  72.8  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.44 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.46 
 
 		 716 aa  72.4  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.33 
 
 		 752 aa  72.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  23.06 
 
 		 952 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  23.73 
 
 		 619 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  23.95 
 
 		 901 aa  70.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  24.46 
 
 		 521 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  23.23 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.52 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  24.4 
 
 		 902 aa  68.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  25.9 
 
 		 941 aa  67.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.04 
 
 		 643 aa  67  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.17 
 
 		 633 aa  67  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.77 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.53 
 
 		 1111 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.3 
 
 		 1620 aa  65.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.57 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.83 
 
 		 1097 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  23.81 
 
 		 1151 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1118 aa  62.4  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  24.29 
 
 		 655 aa  62  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.54 
 
 		 585 aa  61.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.28 
 
 		 315 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.73 
 
 		 1038 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  23.22 
 
 		 1163 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1139 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  22.05 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1215 aa  59.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.01 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  23.41 
 
 		 1143 aa  58.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  23.41 
 
 		 1143 aa  58.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  23.13 
 
 		 1143 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  23.58 
 
 		 748 aa  55.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.21 
 
 		 576 aa  53.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.37 
 
 		 1196 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2767  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.62 
 
 		 769 aa  53.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.83 
 
 		 1999 aa  52.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1116 aa  50.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  25.35 
 
 		 268 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.29 
 
 		 479 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1350 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  32.63 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1247 aa  48.9  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  28.83 
 
 		 1422 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.15 
 
 		 1653 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  21.86 
 
 		 466 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.79 
 
 		 1324 aa  48.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  23.47 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2072  hypothetical protein  33.71 
 
 		 221 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.506515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  51.22 
 
 		 925 aa  48.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.89 
 
 		 1099 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  25.4 
 
 		 2005 aa  47.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.11 
 
 		 573 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  37.14 
 
 		 1950 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  23.21 
 
 		 388 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1018 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.58 
 
 		 1958 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  25.33 
 
 		 283 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.67 
 
 		 598 aa  47.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.8 
 
 		 1189 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  30.47 
 
 		 928 aa  46.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  33.73 
 
 		 2245 aa  46.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1823 aa  46.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  24.43 
 
 		 1945 aa  45.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24 
 
 		 576 aa  45.8  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  23.27 
 
 		 1190 aa  45.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>