More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0557 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1105    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3158  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.06 
 
 		 537 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  60.49 
 
 		 557 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.44 
 
 		 537 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4030  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.17 
 
 		 534 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4997  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.72 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3138  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.53 
 
 		 532 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  50.19 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  50.19 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  50.19 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  50 
 
 		 556 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  49.43 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  49.43 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  49.43 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  49.43 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3525  putative glucose-methanol-choline (GMC)oxidoreductase  47.47 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.59 
 
 		 521 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.35 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.55 
 
 		 552 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  44.09 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  44.63 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.61 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  44.13 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.17 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  42.99 
 
 		 552 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.57 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.92 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  42.12 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.91 
 
 		 537 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.44 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  45.16 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  42.67 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.24 
 
 		 563 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.34 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  42.27 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  43.77 
 
 		 544 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.59 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  43.63 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.02 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  43.58 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.99 
 
 		 554 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  43.33 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  43.38 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  41.92 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  42.78 
 
 		 551 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  41.53 
 
 		 560 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  41.67 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  41.54 
 
 		 565 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.67 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.47 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  40.75 
 
 		 564 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  42.78 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.38 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  40.75 
 
 		 560 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  40.86 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  40.86 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.12 
 
 		 530 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  42.16 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  40.86 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  40.86 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  41.15 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.53 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  43.71 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  40.93 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  40.93 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.28 
 
 		 559 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  41.35 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  41.17 
 
 		 549 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  39.74 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.65 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.17 
 
 		 557 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  41.67 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  40.87 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4277  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.41 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  40.22 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.62 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.6 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  41.87 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  39.41 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.79 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  40.37 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  41.45 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  41.45 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  41.71 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  41.23 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.86 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  41.11 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  41.26 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  41.45 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.48 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  41.71 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  41.26 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  41.3 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.78 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  40.41 
 
 		 549 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.07 
 
 		 547 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.51 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>