More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1138 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1138  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 652 aa  1335    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  63.32 
 
 		 639 aa  855    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.22 
 
 		 655 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 649 aa  104  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 613 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 697 aa  95.5  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 650 aa  94.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  22.47 
 
 		 620 aa  93.6  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.86 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 1128 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 617 aa  92  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 702 aa  91.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.21 
 
 		 706 aa  91.7  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 688 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 634 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 621 aa  90.5  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 617 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 653 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 698 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 698 aa  89  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 698 aa  89  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1548  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 726 aa  88.6  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.58 
 
 		 639 aa  88.2  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 698 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 634 aa  87  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.2 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 626 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 626 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.79 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.81 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  24.23 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 657 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 635 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.58 
 
 		 696 aa  79.7  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  25.32 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.58 
 
 		 696 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 634 aa  77.4  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 661 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.28 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.81 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 625 aa  74.7  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.53 
 
 		 630 aa  74.3  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.09 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.37 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  23.41 
 
 		 622 aa  73.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 616 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.36 
 
 		 611 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.68 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 648 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.51 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 611 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  22.27 
 
 		 647 aa  70.5  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.64 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 891 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.76 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  21.82 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  29.2 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.83 
 
 		 1023 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  40.71 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  36.43 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>