131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2899 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  100 
 
 
1283 aa  2516    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  49.96 
 
 
1286 aa  1144    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  55.98 
 
 
1306 aa  1266    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  49.96 
 
 
1274 aa  1143    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.35 
 
 
1261 aa  311  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.19 
 
 
1284 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  28.05 
 
 
1309 aa  298  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  26.22 
 
 
1307 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.35 
 
 
1288 aa  284  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.43 
 
 
1273 aa  273  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.09 
 
 
1273 aa  273  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  26.03 
 
 
1304 aa  264  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.83 
 
 
1300 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.37 
 
 
1307 aa  248  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.22 
 
 
1305 aa  244  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.08 
 
 
1307 aa  241  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.76 
 
 
1346 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.06 
 
 
1341 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  29.63 
 
 
1141 aa  232  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.66 
 
 
1269 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.16 
 
 
1266 aa  225  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.09 
 
 
1266 aa  225  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.44 
 
 
1265 aa  224  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.84 
 
 
1266 aa  224  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.09 
 
 
1266 aa  224  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.09 
 
 
1266 aa  224  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.95 
 
 
1276 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  24.15 
 
 
1264 aa  222  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.71 
 
 
1266 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.42 
 
 
1266 aa  221  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.63 
 
 
1266 aa  221  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.63 
 
 
1266 aa  221  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.3 
 
 
1266 aa  220  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 
1266 aa  219  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.35 
 
 
1266 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.69 
 
 
1275 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.46 
 
 
1384 aa  219  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.19 
 
 
1266 aa  218  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.35 
 
 
1266 aa  218  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.91 
 
 
1291 aa  217  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.42 
 
 
1276 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.62 
 
 
1273 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.86 
 
 
1265 aa  215  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.25 
 
 
1276 aa  211  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.12 
 
 
1271 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.42 
 
 
1271 aa  208  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.68 
 
 
1271 aa  208  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.93 
 
 
1439 aa  207  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  23.64 
 
 
1331 aa  206  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  25.25 
 
 
1273 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  22.4 
 
 
1392 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.74 
 
 
1267 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.11 
 
 
1443 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.28 
 
 
1441 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.93 
 
 
1271 aa  201  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.3 
 
 
1277 aa  201  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.52 
 
 
1301 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.45 
 
 
1459 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.59 
 
 
1454 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  27.16 
 
 
1394 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.39 
 
 
1446 aa  195  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  23.13 
 
 
1419 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.64 
 
 
1277 aa  191  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.07 
 
 
1284 aa  190  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  24.59 
 
 
1381 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  20.54 
 
 
1323 aa  189  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  23.48 
 
 
1436 aa  189  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.51 
 
 
1416 aa  189  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.96 
 
 
1417 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.85 
 
 
1301 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  23.09 
 
 
1417 aa  181  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  21.93 
 
 
1294 aa  180  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.61 
 
 
1266 aa  179  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.31 
 
 
1383 aa  179  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.43 
 
 
1390 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23.7 
 
 
1399 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  23.7 
 
 
1399 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.21 
 
 
1384 aa  165  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  23.63 
 
 
1399 aa  165  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  23.63 
 
 
1399 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.49 
 
 
1287 aa  164  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  26.69 
 
 
1399 aa  162  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  29.08 
 
 
1153 aa  162  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  29.08 
 
 
1153 aa  162  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.33 
 
 
1398 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  25.28 
 
 
1379 aa  159  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.31 
 
 
1379 aa  159  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.4 
 
 
1398 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  24.06 
 
 
1224 aa  155  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  24.03 
 
 
1210 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.17 
 
 
1291 aa  150  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  24.04 
 
 
1430 aa  147  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  25.26 
 
 
1472 aa  147  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.63 
 
 
1419 aa  140  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  23.28 
 
 
1428 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.89 
 
 
1380 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.61 
 
 
1419 aa  129  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  28.57 
 
 
1378 aa  129  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  22.45 
 
 
1419 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  28.25 
 
 
1418 aa  128  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>