103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6168 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  100 
 
 		 411 aa  854    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  29.51 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  28.64 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  26.6 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  27.34 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  26.11 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  25.76 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  24.18 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  27.52 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  24.75 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  24.11 
 
 		 461 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  29.32 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  31.8 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  23.68 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  23.74 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  24.05 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  25 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  26.25 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  28.07 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  27.47 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  23.99 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  26.87 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  27.78 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  23.79 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  22.22 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  22.81 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  22.91 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  31.13 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  26.28 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  27.14 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.45 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1678  hypothetical protein  38.96 
 
 		 103 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.25 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.25 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.25 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  24.38 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.66 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  30 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  22.47 
 
 		 352 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  29.45 
 
 		 290 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  29.45 
 
 		 290 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.51 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  26.32 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.52 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.45 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  25.15 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  23.08 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  25.28 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  19.6 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  21.64 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  19.6 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  23.25 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  22.25 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.24 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  22.79 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  22 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  24.08 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  21.64 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  39.68 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  25.89 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.39 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  22.37 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  26.03 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  19.86 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  19.86 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  24.81 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.43 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  22.59 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 204 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  24.71 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  22.41 
 
 		 273 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  26.95 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3374  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 		 328 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 188 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  20.85 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.53 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  28.26 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.62 
 
 		 298 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.47 
 
 		 189 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>