55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4722 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  100 
 
 		 994 aa  1971    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  72.26 
 
 		 1079 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6116  hypothetical protein  56.9 
 
 		 555 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.751728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.77 
 
 		 2262 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  46.67 
 
 		 775 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  45.38 
 
 		 1216 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1969 aa  84.7  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.99 
 
 		 1748 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  44.35 
 
 		 1170 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  31.81 
 
 		 3793 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  48.24 
 
 		 14944 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.24 
 
 		 1507 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.69 
 
 		 1362 aa  65.1  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.9 
 
 		 1607 aa  61.6  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.57 
 
 		 1288 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.46 
 
 		 1266 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.28 
 
 		 1015 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  27.98 
 
 		 1160 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  41.75 
 
 		 1550 aa  58.9  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.11 
 
 		 1383 aa  58.9  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.84 
 
 		 1414 aa  58.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  43.42 
 
 		 441 aa  56.2  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.45 
 
 		 2713 aa  56.2  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.86 
 
 		 1130 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  31.07 
 
 		 2278 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1976 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.71 
 
 		 991 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.4 
 
 		 714 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1329 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37 
 
 		 1132 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.95 
 
 		 3563 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1343 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.42 
 
 		 5453 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.73 
 
 		 3542 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  31.36 
 
 		 1275 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.54 
 
 		 799 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.94 
 
 		 540 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  36.26 
 
 		 972 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  28.66 
 
 		 1247 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.31 
 
 		 1657 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  43.56 
 
 		 5544 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.29 
 
 		 1176 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 1750 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  26.04 
 
 		 669 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.54 
 
 		 1183 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  36.05 
 
 		 565 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  37.04 
 
 		 1668 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.08 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  26.17 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.11 
 
 		 887 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  27.82 
 
 		 4429 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.63 
 
 		 794 aa  45.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.38 
 
 		 1292 aa  45.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  28.87 
 
 		 658 aa  44.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>