210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1866 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  100 
 
 		 503 aa  1031    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.63 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.21 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.57 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.72 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.4 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  37.76 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  37.3 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.13 
 
 		 567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.07 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  31.17 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.76 
 
 		 528 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.39 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.26 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.78 
 
 		 533 aa  143  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.34 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.27 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  26.54 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.13 
 
 		 552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.13 
 
 		 552 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.04 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  37.34 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  26.06 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  30.87 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.59 
 
 		 598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.93 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.71 
 
 		 539 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  28.67 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.51 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.72 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  26.02 
 
 		 552 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.15 
 
 		 550 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  25.78 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.24 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  30.25 
 
 		 550 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  28.82 
 
 		 553 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.12 
 
 		 550 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.09 
 
 		 549 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  27.92 
 
 		 557 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  27.29 
 
 		 557 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  27.29 
 
 		 557 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  25.97 
 
 		 560 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  26.93 
 
 		 597 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.52 
 
 		 558 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.74 
 
 		 571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  27.52 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  34.84 
 
 		 574 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  27.52 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.05 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.73 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.35 
 
 		 563 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.93 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.03 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.11 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.38 
 
 		 549 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.89 
 
 		 558 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  27.49 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.75 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.34 
 
 		 558 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  28.44 
 
 		 555 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.44 
 
 		 944 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  32.17 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  38 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  32.75 
 
 		 674 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.27 
 
 		 529 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  26.13 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  26.69 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.9 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  44.35 
 
 		 325 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  26.07 
 
 		 532 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  26.13 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  26.07 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  26.07 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  26.07 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  36.84 
 
 		 548 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  25.7 
 
 		 541 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  25.95 
 
 		 528 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.2 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.2 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  27.2 
 
 		 466 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  36.67 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  25.7 
 
 		 506 aa  96.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  25.45 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.22 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.22 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  26.35 
 
 		 529 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.63 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.67 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  26.99 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.68 
 
 		 623 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.99 
 
 		 466 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.86 
 
 		 466 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  27.17 
 
 		 563 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.83 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.47 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.48 
 
 		 466 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.09 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  28.23 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.88 
 
 		 319 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.8 
 
 		 318 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>