247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  50.52 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0178  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 324 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 72 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 403 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.89 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.89 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.89 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.89 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  45.1 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  46.94 
 
 		 193 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  31.55 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>