More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 253 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  54.17 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  59.31 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  53.98 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  44.67 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  43.05 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  40.72 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  43.32 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  41.89 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.9 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  25.74 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  34.68 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  25.68 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.81 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.52 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.19 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  30.66 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  29.91 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  31.94 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.84 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  31.63 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  32.74 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.91 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1699  GntR domain-containing protein  28.25 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330463  hitchhiker  0.0000606357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  33.8 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.84 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.04 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  31.74 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.42 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.95 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  32.13 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.9 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  25.23 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.14 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.22 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.14 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  24.77 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  31.8 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  32.04 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  28.14 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.42 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  31.15 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.8 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.16 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.09 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>