235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3423 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  100 
 
 		 346 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  96.53 
 
 		 346 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  92.2 
 
 		 346 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  82.12 
 
 		 347 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  68.14 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  71.2 
 
 		 398 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  71.79 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  71.15 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  49.85 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  49.84 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.49 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  49.35 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  46.75 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  45.79 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  46.34 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.82 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  36.04 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  35.07 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  32.62 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.8 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.3 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.6 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.55 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  34.8 
 
 		 623 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  27.54 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.24 
 
 		 574 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.27 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.91 
 
 		 555 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  25.3 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.68 
 
 		 674 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.13 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.58 
 
 		 579 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.87 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.04 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.53 
 
 		 944 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.43 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.54 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.2 
 
 		 1103 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.33 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.91 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.37 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.51 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.89 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.31 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.83 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  26.79 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  26.99 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.24 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.95 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.11 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.85 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.17 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  26.24 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  28.71 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  28.95 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  33.09 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  28.46 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.32 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.88 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.87 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  28.16 
 
 		 764 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.8 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.28 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  27.73 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  27.91 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.52 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.99 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  30.17 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.17 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.1 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.1 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.1 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.73 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.05 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.23 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  29.44 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.84 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  26.79 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  32.45 
 
 		 584 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  28.23 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  27.75 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25 
 
 		 563 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.1 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.94 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  28.77 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  27.76 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  28.92 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.93 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.27 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.84 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.75 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.82 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  28.82 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  26.05 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>