More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1958 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  100 
 
 		 431 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  67.75 
 
 		 430 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  67.75 
 
 		 430 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  36.46 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  33.87 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  34.51 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  34.51 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  30.77 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  30.77 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  34.72 
 
 		 341 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  30.75 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  28.57 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.9 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.88 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  29.38 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  28.74 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  28.74 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  28.74 
 
 		 446 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.89 
 
 		 398 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.43 
 
 		 417 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  28.35 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  31.77 
 
 		 273 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.69 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  25.67 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.08 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.97 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  26.62 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.72 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.78 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.69 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.27 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.48 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  27.4 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  31.61 
 
 		 190 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  27.6 
 
 		 346 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.74 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.76 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.61 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.59 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.64 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.19 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.04 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  23.68 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.88 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  26.18 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.31 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.49 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.43 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.26 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.6 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.26 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1930  phage integrase  29.33 
 
 		 193 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  23.95 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.73 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.47 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.39 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.28 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  23.97 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.89 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.78 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.13 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  23.76 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.9 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  22.61 
 
 		 275 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.27 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.41 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.33 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.33 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.94 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  23.69 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.27 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  22.03 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.24 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.59 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.8 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.78 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.75 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  21.86 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.38 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.33 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.53 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  29.19 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  26.22 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  26.74 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  22.83 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  23.57 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>