38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1930 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1930  phage integrase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  30.43 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  27.78 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  29.33 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  27.78 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  29.41 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.27 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  30.46 
 
 		 402 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 503 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  39.44 
 
 		 346 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  29.89 
 
 		 401 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  26.67 
 
 		 422 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  27.91 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 368 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 403 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 383 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  27.21 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.51 
 
 		 365 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  22.97 
 
 		 503 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.09 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  32 
 
 		 392 aa  44.7  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 324 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.81 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  26.39 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  30.09 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 409 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.86 
 
 		 397 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 383 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  21.38 
 
 		 507 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.85 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.85 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.21 
 
 		 381 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 376 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.71 
 
 		 414 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>