More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1102 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  100 
 
 		 709 aa  1412    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  43.77 
 
 		 670 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  40.9 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 622 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  32.39 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 622 aa  227  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  32.27 
 
 		 615 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.23 
 
 		 702 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  34.15 
 
 		 776 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  29.78 
 
 		 789 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 595 aa  200  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  29.65 
 
 		 620 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.37 
 
 		 613 aa  197  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.09 
 
 		 647 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  30.39 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 653 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.4 
 
 		 663 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  29.08 
 
 		 665 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  28.95 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  27.63 
 
 		 653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.24 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.02 
 
 		 661 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  26.62 
 
 		 588 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  29.97 
 
 		 652 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  27.85 
 
 		 661 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.21 
 
 		 661 aa  170  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 677 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.3 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  28.52 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  28.75 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  27.7 
 
 		 639 aa  161  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  29.14 
 
 		 607 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  27.4 
 
 		 627 aa  160  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  29.11 
 
 		 643 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  27.54 
 
 		 639 aa  160  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.97 
 
 		 607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.16 
 
 		 633 aa  150  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 627 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26 
 
 		 653 aa  140  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 674 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 598 aa  138  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  25.62 
 
 		 594 aa  127  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.07 
 
 		 573 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.74 
 
 		 583 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  27.19 
 
 		 806 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 583 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 583 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.82 
 
 		 793 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 580 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27 
 
 		 793 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  24.78 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 820 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  25.94 
 
 		 673 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  25.37 
 
 		 611 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  26.37 
 
 		 574 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.55 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  25.4 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.29 
 
 		 657 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  25.37 
 
 		 629 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.72 
 
 		 791 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.17 
 
 		 802 aa  107  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.55 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  24.74 
 
 		 578 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  24.74 
 
 		 578 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  25.74 
 
 		 593 aa  104  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  25.21 
 
 		 612 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  24.32 
 
 		 575 aa  104  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  25.2 
 
 		 578 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.57 
 
 		 808 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.07 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.72 
 
 		 784 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.53 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 752 aa  101  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.23 
 
 		 558 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.04 
 
 		 770 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  26.74 
 
 		 603 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 598 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  24.73 
 
 		 577 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  24.08 
 
 		 571 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 571 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  23.59 
 
 		 564 aa  99.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 677 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 677 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.78 
 
 		 576 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.81 
 
 		 768 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 618 aa  98.6  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.16 
 
 		 579 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  25.21 
 
 		 577 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  25.21 
 
 		 577 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 760 aa  97.8  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  25.21 
 
 		 577 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  25.21 
 
 		 577 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  23.27 
 
 		 573 aa  97.4  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  23.09 
 
 		 765 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  25 
 
 		 577 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.19 
 
 		 752 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.89 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>