More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4689 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 341 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4259  TPR repeat-containing protein  88.79 
 
 		 341 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.104554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1276 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1094 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 4079 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 4489 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.6 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.32 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 711 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 643 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.74 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 3560 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 927 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.63 
 
 		 1979 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.39 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.08 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.74 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 646 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 3035 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 1737 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.27 
 
 		 466 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.76 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 784 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.94 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 3145 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.65 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 878 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.86 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 		 1694 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 3172 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 649 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 649 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 714 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1454  hypothetical protein  30.11 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 632 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.11 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.45 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 248 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.62 
 
 		 1056 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1192 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1676 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.83 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.04 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 2262 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1038 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.24 
 
 		 739 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 637 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 909 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.17 
 
 		 865 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  35.04 
 
 		 1237 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  35 
 
 		 612 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.92 
 
 		 581 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 739 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.48 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 732 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 747 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 686 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.59 
 
 		 576 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.47 
 
 		 816 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 		 3301 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 594 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.81 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 955 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>