More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4136 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  60.41 
 
 		 778 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  84.34 
 
 		 779 aa  1310    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  909    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  60.86 
 
 		 786 aa  908    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  910    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  60.57 
 
 		 788 aa  911    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1583    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  60.88 
 
 		 778 aa  918    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  47.4 
 
 		 794 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1583    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  59.34 
 
 		 788 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  60.72 
 
 		 790 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  60.03 
 
 		 784 aa  892    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  909    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  59.89 
 
 		 784 aa  890    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  60.72 
 
 		 790 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  60.55 
 
 		 778 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  49.3 
 
 		 804 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  39.27 
 
 		 760 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 761 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 821 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 796 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 782 aa  356  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 874 aa  348  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  30.39 
 
 		 780 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 718 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 742 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 737 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 742 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 719 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 762 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 764 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 709 aa  87.4  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 716 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 708 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.09 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.18 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.95 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  26.18 
 
 		 753 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  30 
 
 		 725 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.59 
 
 		 755 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.59 
 
 		 755 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 719 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.42 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 763 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  29.64 
 
 		 698 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 753 aa  75.5  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 679 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.84 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 731 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 731 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 731 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.48 
 
 		 769 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 657 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 706 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 730 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 706 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.36 
 
 		 755 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 777 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 777 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.45 
 
 		 1186 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  22.37 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 731 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>