More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3843 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 427 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 427 aa  832    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  65.4 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.94 
 
 		 475 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.09 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  30.18 
 
 		 457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  30.18 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 438 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 542 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 457 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  37.42 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 578 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 448 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 450 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 442 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.42 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 437 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 850 aa  89  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.06 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  28.17 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>