More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4744 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  100 
 
 		 349 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5468  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0233856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 412 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.23 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  40.41 
 
 		 560 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 472 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.24 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.49 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.67 
 
 		 487 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  35.08 
 
 		 474 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 454 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.9 
 
 		 472 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.67 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 463 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.62 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  38 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  36.5 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  36.5 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  36.5 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  37.3 
 
 		 455 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.01 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 624 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  38.26 
 
 		 468 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  30.87 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  31.97 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  36.15 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.45 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  35.62 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.49 
 
 		 477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 454 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  33.45 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 608 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 467 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  35.47 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 445 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 484 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 408 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  36.49 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  37.25 
 
 		 423 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  36.36 
 
 		 433 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.18 
 
 		 482 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  32.9 
 
 		 457 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.18 
 
 		 490 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  32.99 
 
 		 366 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  34.42 
 
 		 589 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.15 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34.09 
 
 		 594 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 477 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.89 
 
 		 572 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  33.44 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32.17 
 
 		 563 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 480 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  33.67 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  31.96 
 
 		 634 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  32.86 
 
 		 428 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.57 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  31.18 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  31.18 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  36.61 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.45 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.02 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>