296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0325 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  68.46 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  66.67 
 
 		 135 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  65.65 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  66.67 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  69.83 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  66.38 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  51.3 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  51.79 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  49.12 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  46.9 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  42.19 
 
 		 122 aa  97.1  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  47.86 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  45.24 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  54.63 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  46.49 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  46.15 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  46.73 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.07 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  51.09 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  46.6 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  42.59 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  40.71 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  49.46 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.82 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  36.7 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.54 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  40.2 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.07 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.69 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.21 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.82 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  39.82 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.9 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  41.53 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  45.16 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.43 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  42.27 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  38.74 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  26.61 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  31.33 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  29.03 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  47.37 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.77 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.09 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.05 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34.55 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  31.58 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.23 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  37.89 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  34.94 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.86 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.46 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.37 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.46 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  35.51 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.72 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  35.19 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  40.96 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  31.43 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  30.3 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  27.88 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.4 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.86 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>