101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3773 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 161 aa  322  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  71.24 
 
 		 161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.47 
 
 		 577 aa  53.9  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 536 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 216 aa  51.2  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 583 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 137 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  29.66 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.24 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.24 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 314 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 326 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.65 
 
 		 315 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  29.49 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  39.44 
 
 		 473 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  27.78 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  27.43 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.73 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  26.28 
 
 		 203 aa  44.3  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.53 
 
 		 424 aa  44.3  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 291 aa  44.3  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.34 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25489  predicted protein  36.23 
 
 		 274 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283789 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27463  predicted protein  36.23 
 
 		 274 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00352572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.07 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  38.36 
 
 		 343 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 299 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 178 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  31.85 
 
 		 162 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 151 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  37.1 
 
 		 164 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 143 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  31.85 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  31.03 
 
 		 342 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  26.96 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  31.63 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 345 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 269 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  26.87 
 
 		 317 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32.43 
 
 		 292 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.43 
 
 		 258 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  39.22 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 345 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 320 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  51.72 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  23.4 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  28.12 
 
 		 236 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>