85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3254 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 457 aa  907    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.07 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 		 324 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.96 
 
 		 1343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  37.18 
 
 		 205 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 898 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  28.07 
 
 		 903 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 871 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 		 1711 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 1106 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.69 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.67 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.6 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.93 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.8 
 
 		 1088 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 1760 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  33.56 
 
 		 1160 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 		 798 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1097 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 658 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.82 
 
 		 925 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 843 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  19.56 
 
 		 783 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.57 
 
 		 902 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 278 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 1004 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 615 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 579 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 578 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  26.09 
 
 		 331 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 578 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  26.96 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.1 
 
 		 1619 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.54 
 
 		 704 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  27.12 
 
 		 770 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.07 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.39 
 
 		 704 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.02 
 
 		 729 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 		 633 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 		 629 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.34 
 
 		 1240 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 		 1686 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  28.14 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.51 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 		 261 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  21.29 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  25.85 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 		 1557 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 		 839 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.28 
 
 		 1196 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  27.1 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  27.15 
 
 		 576 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  21.54 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  50 
 
 		 540 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 		 652 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1603  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>