More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1229 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  86.29 
 
 		 255 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  63.37 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  65.04 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  63.37 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  65.98 
 
 		 248 aa  294  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  62.95 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  61.38 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  61.38 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  56.85 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  58.27 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  57.79 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  57.66 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  54.07 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  52.85 
 
 		 257 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  49.19 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  48.55 
 
 		 597 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  50.61 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  47.13 
 
 		 594 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.74 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  48.4 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  48.96 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.77 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  47.98 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  48.57 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  46.72 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  48.24 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 250 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.94 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  47.01 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  48.58 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  46.34 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  46.34 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.72 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.18 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  43.03 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.78 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  49.59 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  43.43 
 
 		 259 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.03 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.1 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  47.15 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.9 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  48.36 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  44.31 
 
 		 259 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  44.53 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  45.53 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.27 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.86 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  41.87 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.36 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.4 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  46.75 
 
 		 484 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.82 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  40.89 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  44.94 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.68 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  45.31 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  40.41 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.41 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.04 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.95 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  44.13 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.39 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  41.98 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  43.82 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.2 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.09 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.63 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  41.06 
 
 		 842 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.43 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  42.62 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  44.03 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>