More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1857 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 591 aa  1151    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  45.35 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  45.42 
 
 		 588 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  43.58 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  45.7 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  45.58 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  45.1 
 
 		 588 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  40.14 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  39.8 
 
 		 588 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  41.19 
 
 		 589 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  44.17 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  35.79 
 
 		 593 aa  336  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  37.31 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  38.26 
 
 		 583 aa  327  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  37.68 
 
 		 622 aa  323  7e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  36.99 
 
 		 634 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.06 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.42 
 
 		 596 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.31 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.31 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  34.08 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.13 
 
 		 588 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  36.24 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  36.38 
 
 		 574 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  40.33 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.62 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.55 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.36 
 
 		 575 aa  293  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  38.42 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  34.66 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.19 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  34.36 
 
 		 575 aa  290  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 		 575 aa  290  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.66 
 
 		 574 aa  289  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  34.96 
 
 		 575 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.84 
 
 		 609 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.85 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.88 
 
 		 575 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  35.15 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.64 
 
 		 624 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  36.16 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  36.07 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  35.03 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.66 
 
 		 602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.66 
 
 		 602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  34.88 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.93 
 
 		 592 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.71 
 
 		 622 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  38.05 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.49 
 
 		 602 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 574 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 575 aa  279  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  35.68 
 
 		 574 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.61 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  37.26 
 
 		 618 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.28 
 
 		 599 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.39 
 
 		 607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 		 574 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  37.3 
 
 		 583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  33.9 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.89 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  33.16 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.55 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.73 
 
 		 601 aa  271  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  32.17 
 
 		 575 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.01 
 
 		 605 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  34.64 
 
 		 575 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.83 
 
 		 605 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.6 
 
 		 627 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.69 
 
 		 609 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  33.1 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.87 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  37.9 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  33.56 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  34.03 
 
 		 614 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  33.02 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.5 
 
 		 593 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.73 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  34.01 
 
 		 606 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.73 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  33.55 
 
 		 619 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  33.67 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  32.61 
 
 		 593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.57 
 
 		 608 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  34.01 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  33 
 
 		 609 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  32.3 
 
 		 616 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  33.17 
 
 		 606 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  32.64 
 
 		 592 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  30.9 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  31.6 
 
 		 619 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  33.28 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  30.72 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  33.56 
 
 		 605 aa  246  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>