More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0990 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 410 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 878 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.6 
 
 		 810 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.8 
 
 		 729 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.54 
 
 		 632 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 4079 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 3301 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 1737 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3172 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.03 
 
 		 1694 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1121 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 		 2240 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 3145 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.88 
 
 		 887 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.41 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.19 
 
 		 733 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 3035 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25 
 
 		 681 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1276 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.07 
 
 		 745 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 718 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.49 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.94 
 
 		 1154 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.15 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 689 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.59 
 
 		 594 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.75 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 789 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5445  hypothetical protein  23.1 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  0.835503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.88 
 
 		 622 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1676 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 3560 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.89 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1450 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  29.72 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.4 
 
 		 661 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1276 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 		 681 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.1 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 612 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 		 818 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 		 1013 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  29.61 
 
 		 979 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1192 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.12 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1406 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 1979 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.23 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.03 
 
 		 884 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.73 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 		 875 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1003  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 2262 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 722 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 750 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.19 
 
 		 623 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.23 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>