More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2424 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 354 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  93.79 
 
 		 358 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  51.76 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  51.76 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  43.27 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 362 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 721 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 648 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 709 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 991 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1093 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 941 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1654 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 732 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1560 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1676 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 771 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 864 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 739 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 2693 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 532 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.18 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 681 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 747 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 3706 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 437 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.48 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 767 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 815 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 488 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  28.31 
 
 		 624 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 693 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 1714 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 945 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1227 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 878 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 874 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1051 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 439 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 603 aa  99.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 732 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.63 
 
 		 783 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 462 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 739 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 215 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 746 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 752 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 547 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  32.93 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  32.86 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 764 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 465 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 727 aa  97.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.44 
 
 		 744 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.11 
 
 		 895 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 1239 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 875 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 771 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 723 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  31.47 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 232 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.49 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 1253 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 1177 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 871 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>