More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2205 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 928 aa  1778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  59.04 
 
 		 928 aa  942    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  87.18 
 
 		 932 aa  1549    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  55.37 
 
 		 942 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 		 3954 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.05 
 
 		 1499 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.65 
 
 		 1156 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.94 
 
 		 855 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.49 
 
 		 1079 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.89 
 
 		 1480 aa  124  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 4334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.01 
 
 		 4723 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.44 
 
 		 3598 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.19 
 
 		 1582 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  27.86 
 
 		 1217 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.64 
 
 		 2954 aa  110  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.47 
 
 		 2911 aa  109  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.32 
 
 		 1363 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.35 
 
 		 1279 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.59 
 
 		 682 aa  105  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.13 
 
 		 4798 aa  104  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  30.45 
 
 		 1400 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  31.27 
 
 		 518 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.88 
 
 		 1180 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.52 
 
 		 860 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  28.04 
 
 		 1164 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.01 
 
 		 820 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 795 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  28.89 
 
 		 2836 aa  95.9  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.79 
 
 		 3209 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.66 
 
 		 946 aa  94.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  27.81 
 
 		 1168 aa  94.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1424 aa  92  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.53 
 
 		 2667 aa  91.3  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 537 aa  90.5  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 1855 aa  89.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  32.71 
 
 		 959 aa  89  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.08 
 
 		 556 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.02 
 
 		 824 aa  88.2  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  29.03 
 
 		 1839 aa  87.8  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.83 
 
 		 1415 aa  87.8  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.61 
 
 		 3608 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.23 
 
 		 1403 aa  87.8  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29 
 
 		 2689 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.48 
 
 		 1557 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  29.36 
 
 		 998 aa  85.9  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  36.3 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.62 
 
 		 3193 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 1884 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1895 aa  84.7  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.23 
 
 		 2467 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 2107 aa  84.3  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  29.74 
 
 		 998 aa  84  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.55 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.58 
 
 		 980 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.45 
 
 		 5769 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.17 
 
 		 833 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.78 
 
 		 1534 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 		 2678 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  35.11 
 
 		 3026 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 313 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 		 485 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  34.17 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.84 
 
 		 1055 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  32.85 
 
 		 1112 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  32.84 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.17 
 
 		 1019 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  45.1 
 
 		 2182 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  43.28 
 
 		 867 aa  77.4  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.64 
 
 		 595 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 475 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51 
 
 		 421 aa  77.4  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  30.05 
 
 		 858 aa  77  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  30.16 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.11 
 
 		 3619 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.8 
 
 		 950 aa  77  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.24 
 
 		 4800 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.76 
 
 		 1236 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.35 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  34.57 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  29.74 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  44.95 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  49.52 
 
 		 3619 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  29.53 
 
 		 1112 aa  75.5  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  49.06 
 
 		 4106 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.44 
 
 		 1145 aa  74.7  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  29.01 
 
 		 3587 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  41.56 
 
 		 2178 aa  74.7  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.49 
 
 		 313 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  25.93 
 
 		 4687 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.86 
 
 		 1963 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  50.6 
 
 		 2105 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.8 
 
 		 2245 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  54.43 
 
 		 572 aa  73.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.74 
 
 		 1532 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.63 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>