178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2055 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 742 aa  1445    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  85.7 
 
 		 739 aa  1081    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  60.61 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  47.29 
 
 		 742 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  50.85 
 
 		 720 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  50.58 
 
 		 703 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  44.15 
 
 		 673 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 663 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  44.8 
 
 		 651 aa  221  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  46.04 
 
 		 617 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  44.13 
 
 		 723 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  43.77 
 
 		 717 aa  211  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  42.29 
 
 		 697 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  44.84 
 
 		 624 aa  201  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  43.94 
 
 		 727 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 		 348 aa  195  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 306 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.45 
 
 		 701 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.45 
 
 		 701 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 730 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  31.99 
 
 		 666 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  43.9 
 
 		 1619 aa  79.7  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  37.84 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.97 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.71 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 575 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 		 229 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 216 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.82 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.68 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.5 
 
 		 320 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  39.56 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  35.4 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  43.68 
 
 		 457 aa  62  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 333 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.37 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 208 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  40.54 
 
 		 212 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.23 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  42.68 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.04 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  44.59 
 
 		 926 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.2 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.2 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.38 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  33 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.2 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  33.68 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  31.37 
 
 		 264 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  32.46 
 
 		 315 aa  57  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.06 
 
 		 239 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 376 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.72 
 
 		 205 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 367 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.02 
 
 		 261 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>