More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0939 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  100 
 
 		 338 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  75.99 
 
 		 330 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  48.05 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  40.18 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  38.23 
 
 		 445 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.22 
 
 		 442 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.12 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.74 
 
 		 848 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  33.14 
 
 		 537 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  37.31 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.86 
 
 		 559 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.34 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.16 
 
 		 578 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.78 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  32.5 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  32.46 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.4 
 
 		 410 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  33.22 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  34.6 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  33.65 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  34.59 
 
 		 603 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.89 
 
 		 462 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  26.67 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.28 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  33.73 
 
 		 510 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  31.88 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.37 
 
 		 611 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.18 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.3 
 
 		 543 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.3 
 
 		 543 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.59 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  31.6 
 
 		 482 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.57 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  33.23 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  32.03 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  32.81 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  32.7 
 
 		 378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  33.91 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.7 
 
 		 547 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.27 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  26.84 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  31.63 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.49 
 
 		 476 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  28.05 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.62 
 
 		 417 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  30.5 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.12 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  30.48 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 421 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.04 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 412 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.16 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  30.16 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  31.48 
 
 		 633 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.69 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.38 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.34 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.22 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.52 
 
 		 416 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.13 
 
 		 446 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.76 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.7 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.34 
 
 		 413 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.34 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.6 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.13 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.74 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.34 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.2 
 
 		 505 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.57 
 
 		 470 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.19 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.27 
 
 		 595 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  29.52 
 
 		 475 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  28 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.85 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.39 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.91 
 
 		 543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  23.24 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.33 
 
 		 501 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  29.38 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  27.14 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  28.39 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  29.27 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  33.18 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.79 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.79 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.99 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.56 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  36.05 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  27.03 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.47 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.39 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.41 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.53 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>