More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2919 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  100 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  43.68 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  44.96 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  40.86 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  41.51 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  42.22 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  37.22 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  39.9 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  40 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  37 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  40.19 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  38.43 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  39.15 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  38.68 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  30.8 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  37.26 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  36.79 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  37.09 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  35.27 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  36.74 
 
 		 336 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  35.85 
 
 		 331 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  39.44 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  38.34 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  35.94 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  36.44 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  36.49 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  34.15 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.71 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  37.31 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.89 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.82 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.91 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.43 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  36.24 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  34.65 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.6 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.49 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  37.14 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.95 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.32 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  34.54 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  33.06 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  35.32 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  33.22 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.18 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.76 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  34.2 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  36.84 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  37.38 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  32.87 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.67 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  36.76 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  34.87 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  41.45 
 
 		 317 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.85 
 
 		 319 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  38.3 
 
 		 374 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.42 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  36.96 
 
 		 440 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  34.02 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  36.11 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 375 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.32 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.64 
 
 		 320 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.19 
 
 		 342 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  33.01 
 
 		 383 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.16 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  35.43 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  35.11 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  32.99 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  33.79 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  33.63 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  35.75 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  32.64 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  34.76 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  33.91 
 
 		 327 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.51 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.14 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  30.17 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  33.69 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  31.74 
 
 		 384 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  33.94 
 
 		 333 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.8 
 
 		 350 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.87 
 
 		 318 aa  92  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  26.03 
 
 		 396 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  32.24 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.86 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 329 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.85 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  32.17 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.64 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>