102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4091 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  72.61 
 
 		 174 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  72.9 
 
 		 157 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  67.07 
 
 		 165 aa  219  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  59.12 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  59.24 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 162 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 162 aa  190  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  32.98 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  28 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.38 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28.72 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.47 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  25.6 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  31.68 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 164 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  31.33 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 147 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 201 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  23.26 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 326 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 336 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  37.14 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 327 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  27.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>