86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3182 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1026 aa  1861    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  61.86 
 
 
798 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  60.71 
 
 
828 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  58.88 
 
 
915 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  61.83 
 
 
813 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  60.99 
 
 
776 aa  486  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.11 
 
 
824 aa  426  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  40.19 
 
 
576 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38 
 
 
478 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.43 
 
 
515 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.04 
 
 
485 aa  211  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 
485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  35.55 
 
 
499 aa  197  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.38 
 
 
554 aa  164  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 
859 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.68 
 
 
502 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.6 
 
 
680 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.82 
 
 
445 aa  135  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.6 
 
 
860 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  39.42 
 
 
619 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.34 
 
 
495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.24 
 
 
728 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.96 
 
 
504 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.53 
 
 
629 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.06 
 
 
479 aa  126  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 
472 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  36.19 
 
 
449 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.44 
 
 
528 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 
474 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 
971 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
718 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
1155 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.61 
 
 
713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  35.66 
 
 
971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.47 
 
 
708 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  32.81 
 
 
486 aa  115  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  30.89 
 
 
527 aa  114  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 
778 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  34.94 
 
 
477 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  30.65 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 
490 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32 
 
 
541 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
489 aa  111  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.84 
 
 
481 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 
839 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.27 
 
 
421 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.09 
 
 
295 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  31.93 
 
 
518 aa  108  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 
523 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 
292 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 
649 aa  107  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.32 
 
 
472 aa  104  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  29.92 
 
 
287 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
766 aa  98.2  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.01 
 
 
818 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.48 
 
 
288 aa  98.2  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.76 
 
 
1022 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.2 
 
 
784 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.2 
 
 
988 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
291 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.75 
 
 
1056 aa  95.5  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.6 
 
 
486 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
522 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  27.41 
 
 
500 aa  93.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 
1056 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.08 
 
 
535 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.49 
 
 
291 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.04 
 
 
570 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 
499 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
479 aa  88.6  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.19 
 
 
616 aa  88.2  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.47 
 
 
553 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.72 
 
 
289 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
442 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.92 
 
 
397 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.93 
 
 
657 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.48 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.87 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  26.97 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  30.59 
 
 
482 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.75 
 
 
497 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50.6 
 
 
268 aa  54.3  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 
798 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40.27 
 
 
2914 aa  48.5  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  34.86 
 
 
1291 aa  48.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>