32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2580 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 1291 aa  2551    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  60.9 
 
 		 1465 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  52.14 
 
 		 1509 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  53.22 
 
 		 1488 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  39.77 
 
 		 298 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  33.07 
 
 		 412 aa  145  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  37.96 
 
 		 233 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  40.26 
 
 		 284 aa  139  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  48.95 
 
 		 229 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  31.58 
 
 		 238 aa  125  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  31.7 
 
 		 366 aa  124  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  34.53 
 
 		 237 aa  124  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  28.32 
 
 		 594 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  31.86 
 
 		 2144 aa  116  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  37.85 
 
 		 284 aa  113  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 557 aa  94.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  30.33 
 
 		 287 aa  91.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  28.64 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  22.52 
 
 		 374 aa  80.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  26.24 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  25.36 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  26.4 
 
 		 466 aa  70.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03890  hypothetical protein  21.29 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5166  hypothetical protein  24.22 
 
 		 373 aa  67.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  22.97 
 
 		 382 aa  67  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  36.64 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  26.32 
 
 		 539 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  33.87 
 
 		 5128 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1440  hypothetical protein  31.58 
 
 		 299 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386026  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  20.83 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  35.87 
 
 		 607 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  34.35 
 
 		 491 aa  45.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>