More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1967 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  50.51 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  40.29 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  39.38 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 392 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.11 
 
 		 394 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  35.02 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.36 
 
 		 447 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.77 
 
 		 417 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.06 
 
 		 429 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.99 
 
 		 380 aa  94.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.75 
 
 		 428 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0597  hypothetical protein  33.53 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0696516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.03 
 
 		 350 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.03 
 
 		 350 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.33 
 
 		 427 aa  89  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.43 
 
 		 344 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.43 
 
 		 344 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.43 
 
 		 344 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.03 
 
 		 344 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.03 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  32.9 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.37 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.97 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.72 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.61 
 
 		 381 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.67 
 
 		 542 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  31.37 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  29.87 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  25.7 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  28.11 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  30.52 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  28.48 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  27.32 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.24 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.93 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  28.38 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  25.79 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  28.39 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.59 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.13 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 466 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  27.67 
 
 		 373 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  28.57 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  26.44 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.89 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  25.89 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 333 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  29.45 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  28.24 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  27.04 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  28.85 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  28.41 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 333 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  31.29 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  26.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  26.88 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  26.88 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  27.04 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.08 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.64 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  30.43 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  26.97 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.77 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  26.53 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.14 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>