More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0396 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0396  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 687 aa  1407    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 231 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 210 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.62 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.62 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  32.93 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.68 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.62 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.62 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.62 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.25 
 
 		 344 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.9 
 
 		 210 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.9 
 
 		 210 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.68 
 
 		 327 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.68 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.59 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.74 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.32 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.68 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.96 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 239 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 237 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 230 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 497 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 233 aa  72  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 218 aa  72  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.74 
 
 		 241 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.33 
 
 		 447 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.85 
 
 		 352 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.61 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 218 aa  72  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 487 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.14 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.19 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.04 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 242 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 223 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.52 
 
 		 218 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 219 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 221 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 240 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.22 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 261 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  41.76 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 263 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.78 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.19 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.57 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  35.85 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  40 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  40 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.37 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  30.87 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  43.43 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 359 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 220 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 220 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 220 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 263 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 221 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 220 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 220 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 221 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.27 
 
 		 217 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 466 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>